Задать вопрос юристу
 <<
>>

Компьютерное моделирование комплексов из белка VirE2 и оцДНК


Программой Hex были построены модели взаимодействия оцДНК с одним и двумя белками VirE2. На рис. 3.7 представлена модель взаимодействия оцДНК и двух белков VirE2 в двух проекциях. Расстояние между аминокислотами Lys488 белка VirE2, изображенного желтым цветом, и Glu239 белка VirE2, изображенного красным цветом, составляет 9.2 нм.


Рисунок 3.7 Модель взаимодействия оцДНК и 2-х белков VirE2 (^-вид сверху, ?-вид сбоку). Расстояние между аминокислотами Lys488 белка VirE2, изображенного желтым цветом, и Glu239 белка VirE2, изображенного красным цветом, составляет 9.2 нм.


Как видно из рисунка 3.7, два белка покрывают оцДНК полностью. Пятно контакта между оцДНК и белком VirE2, изображенным желтым цветом, составляет порядка 30 аминокислот и совпадает с участком, который взаимодействует с белком шаперном VirEl [Dym et al., 2008]. Пятно контакта белка VirE2, изображенного красным цветом, и оцДНК составляет 10 аминокислот (Gln385-Arg395). 
<< | >>
Источник: ГУСЕВ Юрий Сергеевич. СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ БЕЛКА VirE2 В ПЕРЕНОСЕ оцДНК ВЭУКАРИОТИЧЕССКИЕ КЛЕТКИ. 2014 {original}

Еще по теме Компьютерное моделирование комплексов из белка VirE2 и оцДНК:

  1. ГУСЕВ Юрий Сергеевич. СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ БЕЛКА VirE2 В ПЕРЕНОСЕ оцДНК ВЭУКАРИОТИЧЕССКИЕ КЛЕТКИ, 2014
  2. Компьютерное молелирование динамики популяций
  3. Моделирование филогенеза
  4. Математическое моделирование динамики популяций
  5. Моделирование континуальности и дискретности
  6. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ЭМИССИИ МЕТАНА ИЗБОЛОТ В АТМОСФЕРУ
  7. ЗАКОНОМЕРНОСТИ ДИНАМИКИ ЧИСЛЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПОПУЛЯЦИЙ
  8. Биосинтез белка
  9. Белка
  10. Белка
  11. О СКОРОСТИ ОБНОВЛЕНИЯ БЕЛКА И ХЛОРОФИЛЛА В ВЫСШИХ РАСТЕНИЯХ [24]
  12. Пептидная теория строения белка