Задать вопрос юристу
 <<
>>

Результаты моделирования


С помощью методов докинга получены стационарные модели комплексов из двух, четырех и шести комплексов белков VirE2, а также модель взаимодействия двух белков VirE2 и оцДНК.
С помощью метода молекулярной динамики установлено, что модель комплекса белков VirE2-VirE1 достигает равновесного, стабильного состояния при времени моделирования до 500 пс.
Также установлено, что структура белка VirE1 в комплексе VirE2-VirE1 обладает наибольшей
подвижностью.
С помощью метода нормальных мод оценены колебательные движения модели комплекса белков VirE2-VirE1, комплексов из двух и четырех белков VirE2. В модели комплекса белков VirE2-VirE1 обнаружены глобальные движения доменов в 1, 2 и 3-х модах, что может подтверждать предположение, сделанное в работе [Dym et al., 2008], что в отсутствие белка-шаперона VirE1 N- и C-домены белка VirE2 приобретают значительные степени свободы относительно друг друга. В комплексе из двух белков VirE2 обнаружены колебательные движения, похожие на открывание-закрывание канала. Среди колебаний комплекса из четырех белков VirE2 не обнаружены изменения конформации внутри поры.
Полученные результаты позволяют получить представление о возможном механизме функционирования порового комплекса из двух белков VirE2, представляющим собой воротный механизм, аналогичный механизму в ионных каналах.
Однако, как происходит перенос Т-ДНК и белка VirE2 внутрь растительных и животных клеток в реальных условиях неизвестно. Выяснению деталей этого процесса на модельных объектах будут посвящены следующие разделы. 
<< | >>
Источник: ГУСЕВ Юрий Сергеевич. СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ БЕЛКА VirE2 В ПЕРЕНОСЕ оцДНК ВЭУКАРИОТИЧЕССКИЕ КЛЕТКИ. 2014 {original}

Еще по теме Результаты моделирования:

  1. Моделирование филогенеза
  2. Математическое моделирование динамики популяций
  3. Моделирование континуальности и дискретности
  4. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ЭМИССИИ МЕТАНА ИЗБОЛОТ В АТМОСФЕРУ
  5. ЗАКОНОМЕРНОСТИ ДИНАМИКИ ЧИСЛЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИЙ. МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПОПУЛЯЦИЙ
  6. Публикации результатов исследований.
  7. РЕЗУЛЬТАТЫ ОПЫТОВ
  8. ПУБЛИКАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛВДОВАНИЙ
  9. Обсуждение результатов исследований
  10. IV. Результаты исследования
  11. 2.2. Результаты исследований